Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.58■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GINS2Q9Y248 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GINS2Q9Y248 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GINS2Q9Y248 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms