Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH9Q9ULB4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH9Q9ULB4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH9Q9ULB4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH9Q9ULB4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH9Q9ULB4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH9Q9ULB4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH9Q9ULB4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH9Q9ULB4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH9Q9ULB4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH9Q9ULB4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH9Q9ULB4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH9Q9ULB4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH9Q9ULB4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH9Q9ULB4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CDH9Q9ULB4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH9Q9ULB4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH9Q9ULB4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH9Q9ULB4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms