Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD4

CIDEB, Cell death activator CIDE-B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEBQ9UHD4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIDEBQ9UHD4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIDEBQ9UHD4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIDEBQ9UHD4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIDEBQ9UHD4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIDEBQ9UHD4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIDEBQ9UHD4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIDEBQ9UHD4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIDEBQ9UHD4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIDEBQ9UHD4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIDEBQ9UHD4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIDEBQ9UHD4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIDEBQ9UHD4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIDEBQ9UHD4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIDEBQ9UHD4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIDEBQ9UHD4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CIDEBQ9UHD4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CIDEBQ9UHD4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms