Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NPC1L1Q9UHC9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NPC1L1Q9UHC9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NPC1L1Q9UHC9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
NPC1L1Q9UHC9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms