Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL2Q9UBD3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms