Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COX16Q9P0S2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COX16Q9P0S2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COX16Q9P0S2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COX16Q9P0S2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COX16Q9P0S2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COX16Q9P0S2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COX16Q9P0S2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COX16Q9P0S2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COX16Q9P0S2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COX16Q9P0S2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COX16Q9P0S2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COX16Q9P0S2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COX16Q9P0S2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COX16Q9P0S2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COX16Q9P0S2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms