Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD93Q9NPY3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD93Q9NPY3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms