Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNPO2LQ9H987 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2LQ9H987 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNPO2LQ9H987 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.9 ms