Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMG9Q9H0W8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG9Q9H0W8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
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