Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2J2Q9GZM3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2J2Q9GZM3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2J2Q9GZM3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2J2Q9GZM3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms