Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
THUMPD2Q9BTF0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
THUMPD2Q9BTF0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
THUMPD2Q9BTF0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
THUMPD2Q9BTF0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
THUMPD2Q9BTF0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
THUMPD2Q9BTF0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
THUMPD2Q9BTF0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
THUMPD2Q9BTF0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
THUMPD2Q9BTF0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
THUMPD2Q9BTF0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
THUMPD2Q9BTF0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
THUMPD2Q9BTF0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
THUMPD2Q9BTF0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
THUMPD2Q9BTF0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
THUMPD2Q9BTF0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
THUMPD2Q9BTF0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
THUMPD2Q9BTF0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
THUMPD2Q9BTF0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms