Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERPUD2Q9BSE4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERPUD2Q9BSE4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HERPUD2Q9BSE4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms