Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UIMC1Q96RL1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
UIMC1Q96RL1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UIMC1Q96RL1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UIMC1Q96RL1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms