Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCORQ96JN0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCORQ96JN0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCORQ96JN0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 384.9 ms