Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HACE1Q8IYU2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACE1Q8IYU2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HACE1Q8IYU2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.9 ms