Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC62Q6P9F0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC62Q6P9F0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC62Q6P9F0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms