Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RWDD4Q6NW29 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RWDD4Q6NW29 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RWDD4Q6NW29 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD4Q6NW29 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD4Q6NW29 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD4Q6NW29 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD4Q6NW29 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD4Q6NW29 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD4Q6NW29 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD4Q6NW29 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.5 ms