Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCARA3Q6AZY7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARA3Q6AZY7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARA3Q6AZY7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARA3Q6AZY7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARA3Q6AZY7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARA3Q6AZY7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARA3Q6AZY7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARA3Q6AZY7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARA3Q6AZY7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARA3Q6AZY7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARA3Q6AZY7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARA3Q6AZY7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARA3Q6AZY7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARA3Q6AZY7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARA3Q6AZY7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARA3Q6AZY7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms