Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBM2

TMEM176B, Transmembrane protein 176B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM176BQ3YBM2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM176BQ3YBM2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM176BQ3YBM2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM176BQ3YBM2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM176BQ3YBM2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM176BQ3YBM2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM176BQ3YBM2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms