Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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