Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE2SQ16763 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE2SQ16763 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE2SQ16763 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
UBE2SQ16763 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBE2SQ16763 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE2SQ16763 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE2SQ16763 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE2SQ16763 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2SQ16763 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2SQ16763 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2SQ16763 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2SQ16763 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2SQ16763 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms