Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 RNF121-207ENST00000526549 2375 ntTSL 211.92□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 57.5
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SF3B4Q15427 RNF121-206ENST00000525243 812 ntTSL 211.05□□□□□ -0.641e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 ARHGEF1-206ENST00000594044 834 ntTSL 512.31□□□□□ -0.444e-28■■■■■ 57.5
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SF3B4Q15427 NDRG2-218ENST00000553593 978 ntTSL 310.14□□□□□ -0.796e-9■■■■■ 57.3
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SF3B4Q15427 NDRG2-228ENST00000554277 410 ntTSL 57.84□□□□□ -1.156e-9■■■■■ 57.3
SF3B4Q15427 NDRG2-278ENST00000635386 672 ntTSL 35.85□□□□□ -1.476e-9■■■■■ 57.3
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SF3B4Q15427 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC8.86□□□□□ -0.996e-74■■■■■ 57.3
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SF3B4Q15427 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.786e-74■■■■■ 57.3
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SF3B4Q15427 GADD45A-203ENST00000460575 874 ntTSL 220.58■□□□□ 0.899e-11■■■■■ 57.2
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SF3B4Q15427 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.719e-11■■■■■ 57.2
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SF3B4Q15427 WDR11-203ENST00000470052 1009 ntTSL 35.27□□□□□ -1.571e-8■■■■■ 57.2
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SF3B4Q15427 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.629e-8■■■■■ 56.7
SF3B4Q15427 DNMT3A-203ENST00000380746 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.789e-8■■■■■ 56.7
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SF3B4Q15427 ARVCF-205ENST00000462319 433 ntTSL 312.86□□□□□ -0.353e-12■■■■■ 56.7
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SF3B4Q15427 CIRBP-227ENST00000590188 361 ntTSL 316.32■□□□□ 0.21e-11■■■■■ 56.7
SF3B4Q15427 FN1-214ENST00000460217 804 ntTSL 29.59□□□□□ -0.871e-14■■■■■ 56.7
SF3B4Q15427 FN1-210ENST00000438981 723 ntTSL 27.22□□□□□ -1.251e-14■■■■■ 56.7
SF3B4Q15427 MTHFR-201ENST00000376486 875 ntTSL 1 (best)17.67■□□□□ 0.423e-13■■■■■ 56.6
SF3B4Q15427 POFUT2-211ENST00000493524 890 ntTSL 513.19□□□□□ -0.39e-9■■■■■ 56.6
SF3B4Q15427 POFUT2-207ENST00000468360 757 ntTSL 511.94□□□□□ -0.59e-9■■■■■ 56.6
SF3B4Q15427 POFUT2-204ENST00000451615 795 ntTSL 510.88□□□□□ -0.679e-9■■■■■ 56.6
SF3B4Q15427 MTHFR-213ENST00000641721 891 nt9.67□□□□□ -0.863e-13■■■■■ 56.6
SF3B4Q15427 DHX29-202ENST00000504778 4557 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.418e-9■■■■■ 56.6
SF3B4Q15427 DHX29-205ENST00000621106 4450 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.758e-9■■■■■ 56.6
SF3B4Q15427 DHX29-201ENST00000251636 4502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.948e-9■■■■■ 56.6
SF3B4Q15427 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.463e-14■■■■■ 56.5
SF3B4Q15427 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.313e-14■■■■■ 56.5
SF3B4Q15427 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.183e-14■■■■■ 56.5
SF3B4Q15427 TBC1D4-207ENST00000493487 458 ntTSL 43.84□□□□□ -1.793e-14■■■■■ 56.5
SF3B4Q15427 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.318e-12■■■■■ 56.5
SF3B4Q15427 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.378e-12■■■■■ 56.5
SF3B4Q15427 FKBP9-209ENST00000475220 567 ntTSL 411.61□□□□□ -0.558e-12■■■■■ 56.5
SF3B4Q15427 FKBP9-212ENST00000490776 2699 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.758e-12■■■■■ 56.5
SF3B4Q15427 FKBP9-207ENST00000471066 591 ntTSL 48.67□□□□□ -1.028e-12■■■■■ 56.5
SF3B4Q15427 DYNC1LI2-206ENST00000564090 566 ntTSL 415.13■□□□□ 0.011e-10■■■■■ 56.5
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