RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588917.2

CIRBP-220, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene CIRBP, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-220ENST00000588917 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.43■■■■■ 5.02
CIRBP-220ENST00000588917 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.03■■■■■ 4.16
CIRBP-220ENST00000588917 ABCC9O60706 1549 aa40.74■■■■■ 4.11
CIRBP-220ENST00000588917 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.75■■■■□ 3.79
CIRBP-220ENST00000588917 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.74■■■■□ 3.79
CIRBP-220ENST00000588917 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
CIRBP-220ENST00000588917 NACADO15069 1562 aa38.55■■■■□ 3.76
CIRBP-220ENST00000588917 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.49■■■■□ 3.75
CIRBP-220ENST00000588917 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.48■■■■□ 3.75
CIRBP-220ENST00000588917 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.32■■■■□ 3.72
CIRBP-220ENST00000588917 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.98■■■■□ 3.671e-14■■□□□ 14.3
CIRBP-220ENST00000588917 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.71■■■■□ 3.63
CIRBP-220ENST00000588917 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.57■■■■□ 3.6
CIRBP-220ENST00000588917 SCRIBQ14160 1630 aa37.43■■■■□ 3.58
CIRBP-220ENST00000588917 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.13■■■■□ 3.53
CIRBP-220ENST00000588917 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.76■■■■□ 3.48
CIRBP-220ENST00000588917 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.72■■■■□ 3.47
CIRBP-220ENST00000588917 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
CIRBP-220ENST00000588917 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
CIRBP-220ENST00000588917 SMARCA4P51532 1647 aa35.87■■■■□ 3.33
CIRBP-220ENST00000588917 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.73■■■■□ 3.31
CIRBP-220ENST00000588917 SMARCA2P51531 1590 aa35.64■■■■□ 3.3
CIRBP-220ENST00000588917 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.63■■■■□ 3.29
CIRBP-220ENST00000588917 NCAPD3P42695 1498 aa35.6■■■■□ 3.29
CIRBP-220ENST00000588917 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
CIRBP-220ENST00000588917 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.55■■■■□ 3.28
CIRBP-220ENST00000588917 HMGXB3Q12766 1538 aa35.39■■■■□ 3.26
CIRBP-220ENST00000588917 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
CIRBP-220ENST00000588917 WIZO95785 1651 aa35.34■■■■□ 3.25
CIRBP-220ENST00000588917 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.28■■■■□ 3.24
CIRBP-220ENST00000588917 ERCC6Q03468 1493 aa35.2■■■■□ 3.23
CIRBP-220ENST00000588917 CUX2O14529 1486 aa35.15■■■■□ 3.22
CIRBP-220ENST00000588917 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
CIRBP-220ENST00000588917 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
CIRBP-220ENST00000588917 NESP48681 1621 aa34.96■■■■□ 3.19
CIRBP-220ENST00000588917 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.7■■■■□ 3.15
CIRBP-220ENST00000588917 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.67■■■■□ 3.14
CIRBP-220ENST00000588917 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.6■■■■□ 3.13
CIRBP-220ENST00000588917 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.59■■■■□ 3.13
CIRBP-220ENST00000588917 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
CIRBP-220ENST00000588917 CFTRP13569 1480 aa34.45■■■■□ 3.1
CIRBP-220ENST00000588917 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.41■■■■□ 3.1
CIRBP-220ENST00000588917 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.24■■■■□ 3.07
CIRBP-220ENST00000588917 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.14■■■■□ 3.06
CIRBP-220ENST00000588917 WDR62O43379 1518 aa34.13■■■■□ 3.05
CIRBP-220ENST00000588917 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.09■■■■□ 3.05
CIRBP-220ENST00000588917 PRDM2Q13029 1718 aa34.07■■■■□ 3.05
CIRBP-220ENST00000588917 ABCC8Q09428 1581 aa33.78■■■■□ 3
CIRBP-220ENST00000588917 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.76■■■■□ 3
CIRBP-220ENST00000588917 TRIM41Q8WV44 630 aa33.68■■■□□ 2.98
CIRBP-220ENST00000588917 OSCARQ8IYS5 282 aa33.63■■■□□ 2.97
CIRBP-220ENST00000588917 TOPBP1Q92547 1522 aa33.62■■■□□ 2.97
CIRBP-220ENST00000588917 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.61■■■□□ 2.97
CIRBP-220ENST00000588917 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.54■■■□□ 2.96
CIRBP-220ENST00000588917 CUX1P39880 1505 aa33.49■■■□□ 2.95
CIRBP-220ENST00000588917 IFT140Q96RY7 1462 aa33.44■■■□□ 2.94
CIRBP-220ENST00000588917 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
CIRBP-220ENST00000588917 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
CIRBP-220ENST00000588917 TOP2BQ02880 1626 aa33.35■■■□□ 2.93
CIRBP-220ENST00000588917 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.34■■■□□ 2.93
CIRBP-220ENST00000588917 SOGA1O94964 1423 aa33.33■■■□□ 2.93
CIRBP-220ENST00000588917 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.31■■■□□ 2.92
CIRBP-220ENST00000588917 SYNJ1O43426 1573 aa33.3■■■□□ 2.92
CIRBP-220ENST00000588917 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.2■■■□□ 2.91
CIRBP-220ENST00000588917 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
CIRBP-220ENST00000588917 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
CIRBP-220ENST00000588917 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.09■■■□□ 2.892e-18■■■■□ 24
CIRBP-220ENST00000588917 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.07■■■□□ 2.89
CIRBP-220ENST00000588917 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
CIRBP-220ENST00000588917 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.03■■■□□ 2.88
CIRBP-220ENST00000588917 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.03■■■□□ 2.88
CIRBP-220ENST00000588917 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.03■■■□□ 2.88
CIRBP-220ENST00000588917 WDR97A6NE52 1622 aa33.02■■■□□ 2.88
CIRBP-220ENST00000588917 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.99■■■□□ 2.87
CIRBP-220ENST00000588917 ARHGEF11O15085 1522 aa32.97■■■□□ 2.87
CIRBP-220ENST00000588917 FBLN2P98095 1184 aa32.94■■■□□ 2.86
CIRBP-220ENST00000588917 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.92■■■□□ 2.86
CIRBP-220ENST00000588917 GRIN2BQ13224 1484 aa32.86■■■□□ 2.85
CIRBP-220ENST00000588917 KIF27Q86VH2 1401 aa32.85■■■□□ 2.85
CIRBP-220ENST00000588917 CHD1O14646 1710 aa32.83■■■□□ 2.85
CIRBP-220ENST00000588917 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.83■■■□□ 2.85
CIRBP-220ENST00000588917 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.81■■■□□ 2.84
CIRBP-220ENST00000588917 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.71■■■□□ 2.83
CIRBP-220ENST00000588917 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
CIRBP-220ENST00000588917 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.71■■■□□ 2.83
CIRBP-220ENST00000588917 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
CIRBP-220ENST00000588917 PBRM1Q86U86 1689 aa32.67■■■□□ 2.82
CIRBP-220ENST00000588917 IGF1RP08069 1367 aa32.65■■■□□ 2.82
CIRBP-220ENST00000588917 ARAP1Q96P48 1450 aa32.64■■■□□ 2.82
CIRBP-220ENST00000588917 SYNJ2O15056 1496 aa32.57■■■□□ 2.8
CIRBP-220ENST00000588917 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.57■■■□□ 2.8
CIRBP-220ENST00000588917 EEA1Q15075 1411 aa32.56■■■□□ 2.8
CIRBP-220ENST00000588917 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.56■■■□□ 2.8
CIRBP-220ENST00000588917 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.52■■■□□ 2.8
CIRBP-220ENST00000588917 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
CIRBP-220ENST00000588917 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.48■■■□□ 2.79
CIRBP-220ENST00000588917 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.47■■■□□ 2.79
CIRBP-220ENST00000588917 ADAMTS12P58397 1594 aa32.47■■■□□ 2.79
CIRBP-220ENST00000588917 CUL7Q14999 1698 aa32.46■■■□□ 2.79
CIRBP-220ENST00000588917 GRIN2AQ12879 1464 aa32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms