RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591363.5

THOP1-213, Transcript of thimet oligopeptidase 1, human

TSL 5

Gene THOP1, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THOP1-213	ENST00000591363	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.46	■■■■■ 4.07
THOP1-213	ENST00000591363	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		36.11	■■■■□ 3.37
THOP1-213	ENST00000591363	ABCC9	O60706	1549 aa		35.62	■■■■□ 3.29
THOP1-213	ENST00000591363	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		34.17	■■■■□ 3.06
THOP1-213	ENST00000591363	NACAD	O15069	1562 aa		34.06	■■■■□ 3.04
THOP1-213	ENST00000591363	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		34.02	■■■■□ 3.04
THOP1-213	ENST00000591363	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.74	■■■□□ 2.99
THOP1-213	ENST00000591363	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
THOP1-213	ENST00000591363	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.47	■■■□□ 2.95
THOP1-213	ENST00000591363	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.27	■■■□□ 2.92
THOP1-213	ENST00000591363	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.25	■■■□□ 2.91
THOP1-213	ENST00000591363	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		33.05	■■■□□ 2.88
THOP1-213	ENST00000591363	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.93	■■■□□ 2.86
THOP1-213	ENST00000591363	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.9	■■■□□ 2.86
THOP1-213	ENST00000591363	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.79	■■■□□ 2.84
THOP1-213	ENST00000591363	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
THOP1-213	ENST00000591363	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.2	■■■□□ 2.75
THOP1-213	ENST00000591363	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.07	■■■□□ 2.72
THOP1-213	ENST00000591363	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.44	■■■□□ 2.62
THOP1-213	ENST00000591363	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.41	■■■□□ 2.62
THOP1-213	ENST00000591363	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
THOP1-213	ENST00000591363	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.37	■■■□□ 2.61
THOP1-213	ENST00000591363	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.35	■■■□□ 2.61
THOP1-213	ENST00000591363	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31.22	■■■□□ 2.59
THOP1-213	ENST00000591363	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		31.15	■■■□□ 2.58
THOP1-213	ENST00000591363	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.14	■■■□□ 2.58
THOP1-213	ENST00000591363	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
THOP1-213	ENST00000591363	WIZ	O95785	1651 aa		30.79	■■■□□ 2.52
THOP1-213	ENST00000591363	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.79	■■■□□ 2.52
THOP1-213	ENST00000591363	NES	P48681	1621 aa		30.7	■■■□□ 2.51
THOP1-213	ENST00000591363	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.7	■■■□□ 2.5
THOP1-213	ENST00000591363	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.63	■■■□□ 2.49
THOP1-213	ENST00000591363	CUX2	O14529	1486 aa		30.56	■■■□□ 2.48
THOP1-213	ENST00000591363	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.5	■■■□□ 2.47
THOP1-213	ENST00000591363	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.48	■■■□□ 2.47
THOP1-213	ENST00000591363	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.48	■■■□□ 2.47
THOP1-213	ENST00000591363	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.32	■■■□□ 2.44
THOP1-213	ENST00000591363	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.3	■■■□□ 2.44
THOP1-213	ENST00000591363	CFTR	P13569	1480 aa		30.23	■■■□□ 2.43
THOP1-213	ENST00000591363	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		30.15	■■■□□ 2.42
THOP1-213	ENST00000591363	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		30.14	■■■□□ 2.42
THOP1-213	ENST00000591363	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		30.13	■■■□□ 2.41
THOP1-213	ENST00000591363	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		30.12	■■■□□ 2.41
THOP1-213	ENST00000591363	WDR62	O43379	1518 aa		30.03	■■■□□ 2.4
THOP1-213	ENST00000591363	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.98	■■■□□ 2.39
THOP1-213	ENST00000591363	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.94	■■■□□ 2.38
THOP1-213	ENST00000591363	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
THOP1-213	ENST00000591363	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
THOP1-213	ENST00000591363	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.65	■■■□□ 2.34
THOP1-213	ENST00000591363	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.61	■■■□□ 2.33
THOP1-213	ENST00000591363	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.55	■■■□□ 2.32
THOP1-213	ENST00000591363	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.54	■■■□□ 2.32
THOP1-213	ENST00000591363	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.35	■■■□□ 2.29
THOP1-213	ENST00000591363	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.33	■■■□□ 2.29
THOP1-213	ENST00000591363	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.28	■■■□□ 2.28
THOP1-213	ENST00000591363	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
THOP1-213	ENST00000591363	SOGA1	O94964	1423 aa		29.25	■■■□□ 2.27
THOP1-213	ENST00000591363	CUX1	P39880	1505 aa		29.24	■■■□□ 2.27
THOP1-213	ENST00000591363	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
THOP1-213	ENST00000591363	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.22	■■■□□ 2.27
THOP1-213	ENST00000591363	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.2	■■■□□ 2.26
THOP1-213	ENST00000591363	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.18	■■■□□ 2.26	6e-9	■■■■■ 34.5
THOP1-213	ENST00000591363	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
THOP1-213	ENST00000591363	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.09	■■■□□ 2.25
THOP1-213	ENST00000591363	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.99	■■■□□ 2.23
THOP1-213	ENST00000591363	FBLN2	P98095	1184 aa		28.97	■■■□□ 2.23
THOP1-213	ENST00000591363	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.94	■■■□□ 2.22
THOP1-213	ENST00000591363	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.93	■■■□□ 2.22
THOP1-213	ENST00000591363	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.93	■■■□□ 2.22
THOP1-213	ENST00000591363	CHD1	O14646	1710 aa		28.91	■■■□□ 2.22
THOP1-213	ENST00000591363	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.91	■■■□□ 2.22
THOP1-213	ENST00000591363	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.91	■■■□□ 2.22
THOP1-213	ENST00000591363	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.9	■■■□□ 2.22
THOP1-213	ENST00000591363	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
THOP1-213	ENST00000591363	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.88	■■■□□ 2.21
THOP1-213	ENST00000591363	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.87	■■■□□ 2.21
THOP1-213	ENST00000591363	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
THOP1-213	ENST00000591363	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.81	■■■□□ 2.2
THOP1-213	ENST00000591363	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.8	■■■□□ 2.2
THOP1-213	ENST00000591363	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.78	■■■□□ 2.2
THOP1-213	ENST00000591363	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.75	■■■□□ 2.19
THOP1-213	ENST00000591363	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.75	■■■□□ 2.19
THOP1-213	ENST00000591363	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.75	■■■□□ 2.19
THOP1-213	ENST00000591363	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.73	■■■□□ 2.19
THOP1-213	ENST00000591363	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.6	■■■□□ 2.17
THOP1-213	ENST00000591363	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.59	■■■□□ 2.17
THOP1-213	ENST00000591363	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.56	■■■□□ 2.16
THOP1-213	ENST00000591363	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.56	■■■□□ 2.16
THOP1-213	ENST00000591363	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.54	■■■□□ 2.16
THOP1-213	ENST00000591363	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.53	■■■□□ 2.16
THOP1-213	ENST00000591363	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.46	■■■□□ 2.15
THOP1-213	ENST00000591363	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.44	■■■□□ 2.14
THOP1-213	ENST00000591363	NUP160	Q12769	1436 aa		28.42	■■■□□ 2.14
THOP1-213	ENST00000591363	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.37	■■■□□ 2.13
THOP1-213	ENST00000591363	IGF1R	P08069	1367 aa		28.33	■■■□□ 2.13
THOP1-213	ENST00000591363	CUL7	Q14999	1698 aa		28.27	■■■□□ 2.12
THOP1-213	ENST00000591363	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.21	■■■□□ 2.11
THOP1-213	ENST00000591363	JPH4	Q96JJ6	628 aa		28.18	■■■□□ 2.1
THOP1-213	ENST00000591363	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.18	■■■□□ 2.1
THOP1-213	ENST00000591363	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.15	■■■□□ 2.1

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