RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460575.1

GADD45A-203, Transcript of growth arrest and DNA damage inducible alpha, humanhuman

TSL 2

Gene GADD45A, Length 874 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45A-203ENST00000460575 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.03■■■■■ 6.56
GADD45A-203ENST00000460575 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.25■■■■■ 5.64
GADD45A-203ENST00000460575 ABCC9O60706 1549 aa49.86■■■■■ 5.57
GADD45A-203ENST00000460575 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.64■■■■■ 5.22
GADD45A-203ENST00000460575 NACADO15069 1562 aa47.37■■■■■ 5.17
GADD45A-203ENST00000460575 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.02■■■■■ 5.12
GADD45A-203ENST00000460575 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.82■■■■■ 5.09
GADD45A-203ENST00000460575 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.6■■■■■ 5.05
GADD45A-203ENST00000460575 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
GADD45A-203ENST00000460575 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.38■■■■■ 5.02
GADD45A-203ENST00000460575 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.36■■■■■ 5.01
GADD45A-203ENST00000460575 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.33■■■■■ 5.01
GADD45A-203ENST00000460575 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.22■■■■■ 4.99
GADD45A-203ENST00000460575 SCRIBQ14160 1630 aa45.79■■■■■ 4.92
GADD45A-203ENST00000460575 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.69■■■■■ 4.91
GADD45A-203ENST00000460575 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.09■■■■■ 4.81
GADD45A-203ENST00000460575 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.08■■■■■ 4.81
GADD45A-203ENST00000460575 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.89■■■■■ 4.78
GADD45A-203ENST00000460575 SMARCA4P51532 1647 aa43.7■■■■■ 4.59
GADD45A-203ENST00000460575 NCAPD3P42695 1498 aa43.67■■■■■ 4.58
GADD45A-203ENST00000460575 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.6■■■■■ 4.57
GADD45A-203ENST00000460575 SMARCA2P51531 1590 aa43.54■■■■■ 4.56
GADD45A-203ENST00000460575 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
GADD45A-203ENST00000460575 HMGXB3Q12766 1538 aa43.48■■■■■ 4.55
GADD45A-203ENST00000460575 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.26■■■■■ 4.52
GADD45A-203ENST00000460575 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
GADD45A-203ENST00000460575 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.18■■■■■ 4.5
GADD45A-203ENST00000460575 ERCC6Q03468 1493 aa43.06■■■■■ 4.48
GADD45A-203ENST00000460575 NESP48681 1621 aa42.92■■■■■ 4.46
GADD45A-203ENST00000460575 CUX2O14529 1486 aa42.89■■■■■ 4.46
GADD45A-203ENST00000460575 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.71■■■■■ 4.43
GADD45A-203ENST00000460575 WIZO95785 1651 aa42.7■■■■■ 4.43
GADD45A-203ENST00000460575 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
GADD45A-203ENST00000460575 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.45■■■■■ 4.39
GADD45A-203ENST00000460575 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.4■■■■■ 4.38
GADD45A-203ENST00000460575 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.36■■■■■ 4.37
GADD45A-203ENST00000460575 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
GADD45A-203ENST00000460575 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.35■■■■■ 4.37
GADD45A-203ENST00000460575 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
GADD45A-203ENST00000460575 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.07■■■■■ 4.33
GADD45A-203ENST00000460575 WDR62O43379 1518 aa41.98■■■■■ 4.31
GADD45A-203ENST00000460575 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.97■■■■■ 4.31
GADD45A-203ENST00000460575 CFTRP13569 1480 aa41.96■■■■■ 4.31
GADD45A-203ENST00000460575 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.92■■■■■ 4.3
GADD45A-203ENST00000460575 PRDM2Q13029 1718 aa41.7■■■■■ 4.27
GADD45A-203ENST00000460575 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.65■■■■■ 4.26
GADD45A-203ENST00000460575 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
GADD45A-203ENST00000460575 TOPBP1Q92547 1522 aa41.17■■■■■ 4.18
GADD45A-203ENST00000460575 IFT140Q96RY7 1462 aa41.1■■■■■ 4.17
GADD45A-203ENST00000460575 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.08■■■■■ 4.17
GADD45A-203ENST00000460575 ABCC8Q09428 1581 aa41.07■■■■■ 4.16
GADD45A-203ENST00000460575 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
GADD45A-203ENST00000460575 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
GADD45A-203ENST00000460575 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
GADD45A-203ENST00000460575 OSCARQ8IYS5 282 aa40.84■■■■■ 4.13
GADD45A-203ENST00000460575 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
GADD45A-203ENST00000460575 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
GADD45A-203ENST00000460575 TRIM41Q8WV44 630 aa40.68■■■■■ 4.1
GADD45A-203ENST00000460575 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.61■■■■■ 4.091e-9■■■□□ 19.1
GADD45A-203ENST00000460575 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.58■■■■■ 4.09
GADD45A-203ENST00000460575 CUX1P39880 1505 aa40.57■■■■■ 4.09
GADD45A-203ENST00000460575 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.56■■■■■ 4.08
GADD45A-203ENST00000460575 SOGA1O94964 1423 aa40.51■■■■■ 4.08
GADD45A-203ENST00000460575 CHD1O14646 1710 aa40.5■■■■■ 4.07
GADD45A-203ENST00000460575 WDR97A6NE52 1622 aa40.45■■■■■ 4.07
GADD45A-203ENST00000460575 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.43■■■■■ 4.06
GADD45A-203ENST00000460575 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.43■■■■■ 4.06
GADD45A-203ENST00000460575 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.43■■■■■ 4.06
GADD45A-203ENST00000460575 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
GADD45A-203ENST00000460575 ARHGEF11O15085 1522 aa40.32■■■■■ 4.05
GADD45A-203ENST00000460575 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.29■■■■■ 4.04
GADD45A-203ENST00000460575 FBLN2P98095 1184 aa40.24■■■■■ 4.03
GADD45A-203ENST00000460575 GRIN2BQ13224 1484 aa40.19■■■■■ 4.03
GADD45A-203ENST00000460575 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
GADD45A-203ENST00000460575 PBRM1Q86U86 1689 aa40.15■■■■■ 4.02
GADD45A-203ENST00000460575 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.11■■■■■ 4.01
GADD45A-203ENST00000460575 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.09■■■■■ 4.01
GADD45A-203ENST00000460575 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.08■■■■■ 4.01
GADD45A-203ENST00000460575 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.05■■■■■ 4
GADD45A-203ENST00000460575 SYNJ2O15056 1496 aa40.04■■■■■ 4
GADD45A-203ENST00000460575 SYNJ1O43426 1573 aa40.03■■■■■ 4
GADD45A-203ENST00000460575 TOP2BQ02880 1626 aa40.02■■■■■ 4
GADD45A-203ENST00000460575 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.01■■■■■ 4
GADD45A-203ENST00000460575 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
GADD45A-203ENST00000460575 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.99■■■■□ 3.99
GADD45A-203ENST00000460575 ARAP1Q96P48 1450 aa39.94■■■■□ 3.98
GADD45A-203ENST00000460575 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.86■■■■□ 3.97
GADD45A-203ENST00000460575 ADAMTS12P58397 1594 aa39.78■■■■□ 3.96
GADD45A-203ENST00000460575 GRIN2AQ12879 1464 aa39.69■■■■□ 3.94
GADD45A-203ENST00000460575 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.63■■■■□ 3.93
GADD45A-203ENST00000460575 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.58■■■■□ 3.93
GADD45A-203ENST00000460575 CEP170Q5SW79 1584 aa39.56■■■■□ 3.92
GADD45A-203ENST00000460575 NUP160Q12769 1436 aa39.54■■■■□ 3.92
GADD45A-203ENST00000460575 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.38■■■■□ 3.9
GADD45A-203ENST00000460575 SHROOM2Q13796 1616 aa39.37■■■■□ 3.89
GADD45A-203ENST00000460575 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
GADD45A-203ENST00000460575 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.21■■■■□ 3.87
GADD45A-203ENST00000460575 KIF27Q86VH2 1401 aa39.2■■■■□ 3.87
GADD45A-203ENST00000460575 CUL7Q14999 1698 aa39.16■■■■□ 3.86
GADD45A-203ENST00000460575 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.1 ms