Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MKRN4PQ13434 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MKRN4PQ13434 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MKRN4PQ13434 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
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