Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHAF1AQ13111 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHAF1AQ13111 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHAF1AQ13111 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms