Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4F3Q08477 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP4F3Q08477 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms