Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMC1P62191 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC1P62191 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMC1P62191 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMC1P62191 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMC1P62191 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMC1P62191 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMC1P62191 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMC1P62191 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMC1P62191 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMC1P62191 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMC1P62191 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMC1P62191 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.8 ms