Protein–RNA interactions for Protein: P62140

PPP1CB, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CBP62140 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1CBP62140 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP1CBP62140 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms