Protein–RNA interactions for Protein: P56856

CLDN18, Claudin-18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN18P56856 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN18P56856 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN18P56856 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN18P56856 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms