Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD8P48556 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD8P48556 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMD8P48556 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms