Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
RANGAP1P46060 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RANGAP1P46060 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
RANGAP1P46060 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC40.19■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms