Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDELR1P24390 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDELR1P24390 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDELR1P24390 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms