Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD58P19256 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD58P19256 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD58P19256 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD58P19256 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD58P19256 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD58P19256 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD58P19256 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD58P19256 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD58P19256 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD58P19256 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD58P19256 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD58P19256 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD58P19256 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD58P19256 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD58P19256 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD58P19256 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD58P19256 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD58P19256 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD58P19256 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CD58P19256 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CD58P19256 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD58P19256 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD58P19256 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD58P19256 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD58P19256 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD58P19256 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD58P19256 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD58P19256 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD58P19256 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD58P19256 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD58P19256 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD58P19256 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD58P19256 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD58P19256 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD58P19256 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD58P19256 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD58P19256 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CD58P19256 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CD58P19256 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD58P19256 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD58P19256 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD58P19256 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD58P19256 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD58P19256 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD58P19256 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD58P19256 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD58P19256 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD58P19256 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD58P19256 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD58P19256 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD58P19256 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD58P19256 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD58P19256 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD58P19256 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD58P19256 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD58P19256 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD58P19256 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD58P19256 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD58P19256 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD58P19256 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD58P19256 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD58P19256 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD58P19256 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD58P19256 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD58P19256 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD58P19256 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD58P19256 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD58P19256 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CD58P19256 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CD58P19256 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CD58P19256 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CD58P19256 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CD58P19256 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CD58P19256 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CD58P19256 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CD58P19256 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CD58P19256 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CD58P19256 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CD58P19256 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CD58P19256 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CD58P19256 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CD58P19256 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CD58P19256 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CD58P19256 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CD58P19256 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CD58P19256 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CD58P19256 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CD58P19256 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CD58P19256 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CD58P19256 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CD58P19256 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CD58P19256 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CD58P19256 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD58P19256 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD58P19256 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD58P19256 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD58P19256 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD58P19256 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD58P19256 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms