Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOCP08134 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOCP08134 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOCP08134 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOCP08134 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOCP08134 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOCP08134 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOCP08134 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOCP08134 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOCP08134 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOCP08134 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOCP08134 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOCP08134 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOCP08134 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOCP08134 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RHOCP08134 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RHOCP08134 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOCP08134 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOCP08134 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOCP08134 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOCP08134 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOCP08134 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOCP08134 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOCP08134 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOCP08134 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOCP08134 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOCP08134 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOCP08134 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOCP08134 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOCP08134 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOCP08134 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOCP08134 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOCP08134 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOCP08134 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOCP08134 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOCP08134 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOCP08134 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOCP08134 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOCP08134 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOCP08134 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOCP08134 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOCP08134 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOCP08134 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOCP08134 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOCP08134 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOCP08134 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOCP08134 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOCP08134 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOCP08134 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOCP08134 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOCP08134 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOCP08134 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOCP08134 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOCP08134 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOCP08134 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOCP08134 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOCP08134 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOCP08134 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOCP08134 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOCP08134 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOCP08134 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOCP08134 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOCP08134 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOCP08134 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOCP08134 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOCP08134 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOCP08134 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOCP08134 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOCP08134 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOCP08134 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOCP08134 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOCP08134 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOCP08134 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOCP08134 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOCP08134 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOCP08134 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOCP08134 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOCP08134 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOCP08134 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOCP08134 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOCP08134 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOCP08134 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOCP08134 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOCP08134 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOCP08134 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOCP08134 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOCP08134 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOCP08134 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOCP08134 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOCP08134 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOCP08134 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOCP08134 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOCP08134 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOCP08134 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOCP08134 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOCP08134 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RHOCP08134 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOCP08134 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOCP08134 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOCP08134 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms