Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN2P04844 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN2P04844 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN2P04844 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPN2P04844 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPN2P04844 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPN2P04844 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPN2P04844 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPN2P04844 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPN2P04844 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPN2P04844 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPN2P04844 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPN2P04844 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPN2P04844 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RPN2P04844 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPN2P04844 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPN2P04844 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPN2P04844 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN2P04844 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN2P04844 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN2P04844 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN2P04844 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN2P04844 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN2P04844 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN2P04844 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN2P04844 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN2P04844 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN2P04844 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN2P04844 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN2P04844 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN2P04844 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN2P04844 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN2P04844 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN2P04844 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN2P04844 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPN2P04844 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPN2P04844 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN2P04844 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN2P04844 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN2P04844 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN2P04844 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN2P04844 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPN2P04844 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPN2P04844 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPN2P04844 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPN2P04844 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN2P04844 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN2P04844 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN2P04844 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN2P04844 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN2P04844 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN2P04844 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN2P04844 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN2P04844 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN2P04844 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN2P04844 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN2P04844 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN2P04844 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN2P04844 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN2P04844 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN2P04844 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN2P04844 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN2P04844 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPN2P04844 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPN2P04844 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPN2P04844 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPN2P04844 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPN2P04844 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPN2P04844 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPN2P04844 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPN2P04844 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN2P04844 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN2P04844 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN2P04844 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN2P04844 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN2P04844 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN2P04844 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN2P04844 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN2P04844 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN2P04844 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN2P04844 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN2P04844 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPN2P04844 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPN2P04844 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPN2P04844 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPN2P04844 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPN2P04844 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPN2P04844 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPN2P04844 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPN2P04844 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPN2P04844 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPN2P04844 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPN2P04844 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPN2P04844 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPN2P04844 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPN2P04844 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPN2P04844 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPN2P04844 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPN2P04844 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPN2P04844 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms