Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN11O75508 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN11O75508 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN11O75508 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN11O75508 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms