Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN2O60636 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN2O60636 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN2O60636 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN2O60636 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN2O60636 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN2O60636 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN2O60636 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN2O60636 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN2O60636 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN2O60636 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms