Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGTAO43765 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGTAO43765 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGTAO43765 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGTAO43765 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGTAO43765 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGTAO43765 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGTAO43765 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGTAO43765 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGTAO43765 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGTAO43765 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGTAO43765 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGTAO43765 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGTAO43765 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGTAO43765 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGTAO43765 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGTAO43765 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGTAO43765 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGTAO43765 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGTAO43765 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGTAO43765 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGTAO43765 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGTAO43765 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGTAO43765 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGTAO43765 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGTAO43765 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGTAO43765 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGTAO43765 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGTAO43765 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGTAO43765 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGTAO43765 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGTAO43765 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGTAO43765 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGTAO43765 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGTAO43765 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGTAO43765 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGTAO43765 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGTAO43765 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGTAO43765 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGTAO43765 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGTAO43765 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGTAO43765 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGTAO43765 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGTAO43765 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGTAO43765 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGTAO43765 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGTAO43765 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGTAO43765 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGTAO43765 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGTAO43765 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGTAO43765 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGTAO43765 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGTAO43765 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGTAO43765 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGTAO43765 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGTAO43765 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGTAO43765 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGTAO43765 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGTAO43765 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGTAO43765 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SGTAO43765 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGTAO43765 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms