Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HACD1B0YJ81 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACD1B0YJ81 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HACD1B0YJ81 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HACD1B0YJ81 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HACD1B0YJ81 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HACD1B0YJ81 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HACD1B0YJ81 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HACD1B0YJ81 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HACD1B0YJ81 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACD1B0YJ81 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACD1B0YJ81 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HACD1B0YJ81 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms