Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A087X0B3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
A0A087X0B3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A087X0B3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms