Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.343e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 TNS3-210ENST00000469470 584 ntTSL 316.03■□□□□ 0.163e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.063e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.173e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 NET1-201ENST00000355029 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.273e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 NET1-202ENST00000380359 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.413e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 NUMA1-230ENST00000546036 592 ntTSL 210.78□□□□□ -0.683e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 NET1-205ENST00000484741 757 ntTSL 29.36□□□□□ -0.913e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 PLIN2-205ENST00000464326 790 ntTSL 23.18□□□□□ -1.94e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 SF1-218ENST00000489544 584 ntTSL 210.28□□□□□ -0.767e-7■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 KHSRP-202ENST00000594496 999 ntTSL 222.58■■□□□ 1.213e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 KHSRP-212ENST00000600480 851 ntTSL 219.62■□□□□ 0.733e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 OBSL1-206ENST00000462385 951 ntTSL 217.56■□□□□ 0.42e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 FNDC3B-207ENST00000469491 2916 ntTSL 220.86■□□□□ 0.936e-9■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 FNDC3B-212ENST00000494000 2600 ntTSL 1 (best)8.17□□□□□ -1.16e-9■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 MAP4-213ENST00000477765 284 ntTSL 312.93□□□□□ -0.341e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ECI1-202ENST00000561688 705 ntTSL 233.24■■■□□ 2.914e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 231.37■■■□□ 2.615e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.024e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.754e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 GCN1-203ENST00000547369 595 ntTSL 323■■□□□ 1.275e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.254e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DNMT3A-210ENST00000474807 840 ntTSL 522.74■■□□□ 1.234e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 EFNA1-204ENST00000474413 1083 ntTSL 322.24■■□□□ 1.154e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.884e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.874e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 HGS-212ENST00000575058 632 ntTSL 320.27■□□□□ 0.844e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DNMT3A-215ENST00000496570 656 ntTSL 319.97■□□□□ 0.794e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.785e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 HGS-208ENST00000572392 824 ntTSL 519.54■□□□□ 0.724e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.665e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 519.11■□□□□ 0.655e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.594e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DNMT3A-209ENST00000470983 589 ntTSL 318.64■□□□□ 0.574e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.544e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 MED24-230ENST00000584077 552 ntTSL 318.44■□□□□ 0.544e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DNM2-215ENST00000590806 5651 ntTSL 217.69■□□□□ 0.424e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 TKFC-207ENST00000528061 555 ntTSL 317.69■□□□□ 0.422e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DNM2-219ENST00000591818 538 ntTSL 417.5■□□□□ 0.394e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.364e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 SLC38A10-207ENST00000542075 2903 ntTSL 217.24■□□□□ 0.354e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DDX19A-215ENST00000575878 1533 ntTSL 217.05■□□□□ 0.324e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 CDC27-210ENST00000533415 2570 ntTSL 216.62■□□□□ 0.254e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 LASP1-208ENST00000584106 1167 ntTSL 216.39■□□□□ 0.212e-11■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DNM2-221ENST00000593203 2507 ntTSL 216.03■□□□□ 0.164e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DNMT3A-204ENST00000380756 4477 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.064e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.044e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 RNPEP-206ENST00000471105 2093 ntTSL 1 (best)15.17■□□□□ 0.024e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.034e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 TMED9-206ENST00000513799 772 ntTSL 214.79□□□□□ -0.044e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.075e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ACSS2-220ENST00000491533 933 ntTSL 514.53□□□□□ -0.089e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DDX19A-209ENST00000566574 5007 ntTSL 1 (best)13.8□□□□□ -0.24e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.24e-6■□□□□ 9.2
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G3BP1Q13283 DDX19A-201ENST00000302243 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.214e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 GPX2-202ENST00000553522 1134 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.254e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ACSS2-219ENST00000490464 280 ntTSL 313.41□□□□□ -0.269e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DNMT3A-203ENST00000380746 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.284e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 CPNE1-214ENST00000435747 400 ntTSL 312.64□□□□□ -0.395e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 RNPEP-208ENST00000479531 667 ntTSL 212.52□□□□□ -0.414e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DDX19A-214ENST00000569771 3067 ntTSL 1 (best)12.5□□□□□ -0.414e-6■□□□□ 9.2
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G3BP1Q13283 AL109827.1-201ENST00000454607 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.44□□□□□ -0.425e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 GPX2-205ENST00000612794 1084 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.424e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 DDX19A-204ENST00000562140 3121 ntTSL 512.38□□□□□ -0.434e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 NUP43-202ENST00000367402 882 ntTSL 212.25□□□□□ -0.454e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 NUP43-203ENST00000367404 1089 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.484e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 TMED9-205ENST00000510499 821 ntTSL 211.78□□□□□ -0.524e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ACTN1-218ENST00000556343 274 ntTSL 311.43□□□□□ -0.582e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 CDC27-204ENST00000527547 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.594e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 NUP43-204ENST00000403890 1012 ntTSL 211.26□□□□□ -0.614e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.615e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 KHSRP-208ENST00000597656 328 ntTSL 510.37□□□□□ -0.753e-7■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 AP3D1-208ENST00000590683 723 ntTSL 510.35□□□□□ -0.755e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.814e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 EFNA1-205ENST00000497282 719 ntTSL 29.96□□□□□ -0.824e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.874e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 NUP43-206ENST00000543637 576 ntTSL 58.88□□□□□ -0.994e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -14e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 CHKA-205ENST00000530730 582 ntTSL 38.71□□□□□ -1.024e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 GPX2-204ENST00000557323 778 ntTSL 37.86□□□□□ -1.154e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 GPX2-203ENST00000557049 476 ntTSL 36.79□□□□□ -1.324e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 HIF1A-209ENST00000556827 752 ntTSL 25.63□□□□□ -1.515e-8■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 SPDYA-205ENST00000462832 2081 ntTSL 25.09□□□□□ -1.594e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 CDC27-211ENST00000570740 594 ntTSL 54.39□□□□□ -1.714e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.784e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.84e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 CDC27-213ENST00000571643 716 ntTSL 33.82□□□□□ -1.84e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 IARS-209ENST00000473915 610 ntTSL 33.1□□□□□ -1.914e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 ZNF106-209ENST00000567772 900 ntTSL 42.92□□□□□ -1.944e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 TRMT112-204ENST00000537918 559 ntTSL 1 (best)23.38■■□□□ 1.331e-9■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.011e-9■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.981e-9■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.796e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.771e-9■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.531e-9■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.446e-6■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 POR-217ENST00000460892 603 ntTSL 216.71■□□□□ 0.271e-9■□□□□ 9.2
G3BP1Q13283 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21e-9■□□□□ 9.2
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