RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469470.1

TNS3-210, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TNS3, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-210ENST00000469470 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.79■■■■□ 3
TNS3-210ENST00000469470 ABCC9O60706 1549 aa31.15■■■□□ 2.58
TNS3-210ENST00000469470 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.62■■■□□ 2.49
TNS3-210ENST00000469470 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.7■■■□□ 2.35
TNS3-210ENST00000469470 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.41■■■□□ 2.3
TNS3-210ENST00000469470 NACADO15069 1562 aa29.06■■■□□ 2.24
TNS3-210ENST00000469470 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
TNS3-210ENST00000469470 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.75■■■□□ 2.19
TNS3-210ENST00000469470 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.74■■■□□ 2.19
TNS3-210ENST00000469470 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.58■■■□□ 2.17
TNS3-210ENST00000469470 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.46■■■□□ 2.15
TNS3-210ENST00000469470 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.14■■■□□ 2.09
TNS3-210ENST00000469470 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.12■■■□□ 2.09
TNS3-210ENST00000469470 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.12■■■□□ 2.09
TNS3-210ENST00000469470 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
TNS3-210ENST00000469470 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
TNS3-210ENST00000469470 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.88■■■□□ 2.05
TNS3-210ENST00000469470 SCRIBQ14160 1630 aa27.84■■■□□ 2.05
TNS3-210ENST00000469470 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.72■■■□□ 2.03
TNS3-210ENST00000469470 CUX2O14529 1486 aa27.1■■□□□ 1.93
TNS3-210ENST00000469470 ERCC6Q03468 1493 aa26.94■■□□□ 1.9
TNS3-210ENST00000469470 NCAPD3P42695 1498 aa26.82■■□□□ 1.88
TNS3-210ENST00000469470 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.66■■□□□ 1.86
TNS3-210ENST00000469470 HMGXB3Q12766 1538 aa26.6■■□□□ 1.85
TNS3-210ENST00000469470 NESP48681 1621 aa26.59■■□□□ 1.85
TNS3-210ENST00000469470 SMARCA2P51531 1590 aa26.56■■□□□ 1.84
TNS3-210ENST00000469470 SMARCA4P51532 1647 aa26.5■■□□□ 1.83
TNS3-210ENST00000469470 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TNS3-210ENST00000469470 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
TNS3-210ENST00000469470 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.33■■□□□ 1.81
TNS3-210ENST00000469470 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
TNS3-210ENST00000469470 TRIM41Q8WV44 630 aa26.27■■□□□ 1.8
TNS3-210ENST00000469470 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.25■■□□□ 1.79
TNS3-210ENST00000469470 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.25■■□□□ 1.79
TNS3-210ENST00000469470 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.18■■□□□ 1.78
TNS3-210ENST00000469470 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.03■■□□□ 1.76
TNS3-210ENST00000469470 MRC2Q9UBG0 1479 aa26■■□□□ 1.75
TNS3-210ENST00000469470 WDR62O43379 1518 aa25.97■■□□□ 1.75
TNS3-210ENST00000469470 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.96■■□□□ 1.75
TNS3-210ENST00000469470 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.79■■□□□ 1.72
TNS3-210ENST00000469470 OSCARQ8IYS5 282 aa25.73■■□□□ 1.71
TNS3-210ENST00000469470 WIZO95785 1651 aa25.71■■□□□ 1.71
TNS3-210ENST00000469470 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.69■■□□□ 1.7
TNS3-210ENST00000469470 CFTRP13569 1480 aa25.56■■□□□ 1.68
TNS3-210ENST00000469470 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
TNS3-210ENST00000469470 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.5■■□□□ 1.67
TNS3-210ENST00000469470 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.5■■□□□ 1.67
TNS3-210ENST00000469470 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.5■■□□□ 1.67
TNS3-210ENST00000469470 ARHGEF11O15085 1522 aa25.36■■□□□ 1.65
TNS3-210ENST00000469470 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
TNS3-210ENST00000469470 PRDM2Q13029 1718 aa25.29■■□□□ 1.64
TNS3-210ENST00000469470 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
TNS3-210ENST00000469470 IFT140Q96RY7 1462 aa25.28■■□□□ 1.64
TNS3-210ENST00000469470 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TNS3-210ENST00000469470 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.17■■□□□ 1.62
TNS3-210ENST00000469470 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TNS3-210ENST00000469470 TOPBP1Q92547 1522 aa25.14■■□□□ 1.62
TNS3-210ENST00000469470 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TNS3-210ENST00000469470 CHD1O14646 1710 aa25.08■■□□□ 1.61
TNS3-210ENST00000469470 ARAP1Q96P48 1450 aa25.06■■□□□ 1.6
TNS3-210ENST00000469470 ABCC8Q09428 1581 aa25.05■■□□□ 1.6
TNS3-210ENST00000469470 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.03■■□□□ 1.6
TNS3-210ENST00000469470 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.01■■□□□ 1.59
TNS3-210ENST00000469470 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
TNS3-210ENST00000469470 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TNS3-210ENST00000469470 FBLN2P98095 1184 aa24.92■■□□□ 1.58
TNS3-210ENST00000469470 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TNS3-210ENST00000469470 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TNS3-210ENST00000469470 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.77■■□□□ 1.56
TNS3-210ENST00000469470 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.76■■□□□ 1.55
TNS3-210ENST00000469470 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.73■■□□□ 1.55
TNS3-210ENST00000469470 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TNS3-210ENST00000469470 SOGA1O94964 1423 aa24.71■■□□□ 1.55
TNS3-210ENST00000469470 SYNJ1O43426 1573 aa24.7■■□□□ 1.54
TNS3-210ENST00000469470 WDR97A6NE52 1622 aa24.69■■□□□ 1.54
TNS3-210ENST00000469470 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TNS3-210ENST00000469470 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
TNS3-210ENST00000469470 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.61■■□□□ 1.53
TNS3-210ENST00000469470 GRIN2BQ13224 1484 aa24.58■■□□□ 1.52
TNS3-210ENST00000469470 SYNJ2O15056 1496 aa24.57■■□□□ 1.52
TNS3-210ENST00000469470 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.53■■□□□ 1.52
TNS3-210ENST00000469470 CUX1P39880 1505 aa24.5■■□□□ 1.51
TNS3-210ENST00000469470 PBRM1Q86U86 1689 aa24.47■■□□□ 1.51
TNS3-210ENST00000469470 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.33■■□□□ 1.49
TNS3-210ENST00000469470 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.33■■□□□ 1.49
TNS3-210ENST00000469470 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.3■■□□□ 1.48
TNS3-210ENST00000469470 GRIN2AQ12879 1464 aa24.26■■□□□ 1.47
TNS3-210ENST00000469470 CEP170Q5SW79 1584 aa24.25■■□□□ 1.47
TNS3-210ENST00000469470 ADAMTS12P58397 1594 aa24.2■■□□□ 1.46
TNS3-210ENST00000469470 NUP160Q12769 1436 aa24.19■■□□□ 1.46
TNS3-210ENST00000469470 SHROOM2Q13796 1616 aa24.18■■□□□ 1.46
TNS3-210ENST00000469470 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.18■■□□□ 1.46
TNS3-210ENST00000469470 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.07■■□□□ 1.44
TNS3-210ENST00000469470 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
TNS3-210ENST00000469470 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
TNS3-210ENST00000469470 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.99■■□□□ 1.43
TNS3-210ENST00000469470 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.97■■□□□ 1.43
TNS3-210ENST00000469470 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.97■■□□□ 1.43
TNS3-210ENST00000469470 TOP2BQ02880 1626 aa23.95■■□□□ 1.43
TNS3-210ENST00000469470 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms