RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424458.5

RBM12-204, Transcript of RNA binding motif protein 12, humanhuman

TSL 2

Gene RBM12, Length 1,068 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM12-204ENST00000424458 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.26■■■■■ 7.4
RBM12-204ENST00000424458 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.46■■■■■ 6.31
RBM12-204ENST00000424458 ABCC9O60706 1549 aa53.27■■■■■ 6.12
RBM12-204ENST00000424458 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.29■■■■■ 5.8
RBM12-204ENST00000424458 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.26■■■■■ 5.8
RBM12-204ENST00000424458 NACADO15069 1562 aa51.23■■■■■ 5.79
RBM12-204ENST00000424458 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.01■■■■■ 5.76
RBM12-204ENST00000424458 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.93■■■■■ 5.74
RBM12-204ENST00000424458 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.71■■■■■ 5.71
RBM12-204ENST00000424458 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.03■■■■■ 5.6
RBM12-204ENST00000424458 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.8■■■■■ 5.56
RBM12-204ENST00000424458 SCRIBQ14160 1630 aa49.67■■■■■ 5.54
RBM12-204ENST00000424458 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.65■■■■■ 5.54
RBM12-204ENST00000424458 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.24■■■■■ 5.47
RBM12-204ENST00000424458 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.86■■■■■ 5.41
RBM12-204ENST00000424458 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.39■■■■■ 5.34
RBM12-204ENST00000424458 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.18■■■■■ 5.3
RBM12-204ENST00000424458 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.89■■■■■ 5.26
RBM12-204ENST00000424458 SMARCA4P51532 1647 aa47.51■■■■■ 5.2
RBM12-204ENST00000424458 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.5■■■■■ 5.19
RBM12-204ENST00000424458 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.27■■■■■ 5.16
RBM12-204ENST00000424458 NCAPD3P42695 1498 aa47.27■■■■■ 5.16
RBM12-204ENST00000424458 SMARCA2P51531 1590 aa47.25■■■■■ 5.15
RBM12-204ENST00000424458 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.18■■■■■ 5.14
RBM12-204ENST00000424458 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.06■■■■■ 5.12
RBM12-204ENST00000424458 HMGXB3Q12766 1538 aa47.02■■■■■ 5.12
RBM12-204ENST00000424458 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.91■■■■■ 5.1
RBM12-204ENST00000424458 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.67■■■■■ 5.06
RBM12-204ENST00000424458 WIZO95785 1651 aa46.66■■■■■ 5.06
RBM12-204ENST00000424458 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
RBM12-204ENST00000424458 NESP48681 1621 aa46.06■■■■■ 4.96
RBM12-204ENST00000424458 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.02■■■■■ 4.96
RBM12-204ENST00000424458 ERCC6Q03468 1493 aa45.97■■■■■ 4.95
RBM12-204ENST00000424458 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.91■■■■■ 4.94
RBM12-204ENST00000424458 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.76■■■■■ 4.92
RBM12-204ENST00000424458 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.67■■■■■ 4.9
RBM12-204ENST00000424458 CFTRP13569 1480 aa45.61■■■■■ 4.89
RBM12-204ENST00000424458 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.55■■■■■ 4.88
RBM12-204ENST00000424458 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.52■■■■■ 4.88
RBM12-204ENST00000424458 CUX2O14529 1486 aa45.47■■■■■ 4.87
RBM12-204ENST00000424458 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.36■■■■■ 4.85
RBM12-204ENST00000424458 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.36■■■■■ 4.85
RBM12-204ENST00000424458 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.31■■■■■ 4.84
RBM12-204ENST00000424458 PRDM2Q13029 1718 aa45.23■■■■■ 4.83
RBM12-204ENST00000424458 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.23■■■■■ 4.83
RBM12-204ENST00000424458 WDR62O43379 1518 aa45.06■■■■■ 4.8
RBM12-204ENST00000424458 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
RBM12-204ENST00000424458 ABCC8Q09428 1581 aa44.7■■■■■ 4.75
RBM12-204ENST00000424458 TOPBP1Q92547 1522 aa44.62■■■■■ 4.73
RBM12-204ENST00000424458 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.57■■■■■ 4.73
RBM12-204ENST00000424458 IFT140Q96RY7 1462 aa44.38■■■■■ 4.69
RBM12-204ENST00000424458 CUX1P39880 1505 aa44.26■■■■■ 4.68
RBM12-204ENST00000424458 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.23■■■■■ 4.67
RBM12-204ENST00000424458 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.14■■■■■ 4.66
RBM12-204ENST00000424458 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.11■■■■■ 4.65
RBM12-204ENST00000424458 SOGA1O94964 1423 aa44.11■■■■■ 4.65
RBM12-204ENST00000424458 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
RBM12-204ENST00000424458 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.09■■■■■ 4.65
RBM12-204ENST00000424458 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.04■■■■■ 4.64
RBM12-204ENST00000424458 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.03■■■■■ 4.64
RBM12-204ENST00000424458 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
RBM12-204ENST00000424458 TOP2BQ02880 1626 aa43.91■■■■■ 4.62
RBM12-204ENST00000424458 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.89■■■■■ 4.62
RBM12-204ENST00000424458 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.89■■■■■ 4.621e-6■■■■□ 19.4
RBM12-204ENST00000424458 SYNJ1O43426 1573 aa43.85■■■■■ 4.61
RBM12-204ENST00000424458 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
RBM12-204ENST00000424458 WDR97A6NE52 1622 aa43.83■■■■■ 4.61
RBM12-204ENST00000424458 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.73■■■■■ 4.59
RBM12-204ENST00000424458 OSCARQ8IYS5 282 aa43.65■■■■■ 4.58
RBM12-204ENST00000424458 GRIN2BQ13224 1484 aa43.58■■■■■ 4.57
RBM12-204ENST00000424458 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.58■■■■■ 4.57
RBM12-204ENST00000424458 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.51■■■■■ 4.56
RBM12-204ENST00000424458 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.49■■■■■ 4.55
RBM12-204ENST00000424458 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.47■■■■■ 4.55
RBM12-204ENST00000424458 PBRM1Q86U86 1689 aa43.44■■■■■ 4.54
RBM12-204ENST00000424458 FBLN2P98095 1184 aa43.44■■■■■ 4.54
RBM12-204ENST00000424458 CHD1O14646 1710 aa43.38■■■■■ 4.53
RBM12-204ENST00000424458 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
RBM12-204ENST00000424458 SYNJ2O15056 1496 aa43.29■■■■■ 4.52
RBM12-204ENST00000424458 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.22■■■■■ 4.51
RBM12-204ENST00000424458 KIF27Q86VH2 1401 aa43.14■■■■■ 4.5
RBM12-204ENST00000424458 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.1■■■■■ 4.49
RBM12-204ENST00000424458 ADAMTS12P58397 1594 aa43.1■■■■■ 4.49
RBM12-204ENST00000424458 TRIM41Q8WV44 630 aa43.06■■■■■ 4.48
RBM12-204ENST00000424458 GRIN2AQ12879 1464 aa43■■■■■ 4.47
RBM12-204ENST00000424458 IGF1RP08069 1367 aa42.94■■■■■ 4.46
RBM12-204ENST00000424458 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.92■■■■■ 4.46
RBM12-204ENST00000424458 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.84■■■■■ 4.45
RBM12-204ENST00000424458 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.84■■■■■ 4.45
RBM12-204ENST00000424458 ARHGEF11O15085 1522 aa42.84■■■■■ 4.45
RBM12-204ENST00000424458 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.84■■■■■ 4.45
RBM12-204ENST00000424458 CUL7Q14999 1698 aa42.82■■■■■ 4.44
RBM12-204ENST00000424458 NUP160Q12769 1436 aa42.8■■■■■ 4.44
RBM12-204ENST00000424458 CEP170Q5SW79 1584 aa42.74■■■■■ 4.43
RBM12-204ENST00000424458 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.71■■■■■ 4.43
RBM12-204ENST00000424458 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.66■■■■■ 4.42
RBM12-204ENST00000424458 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.51■■■■■ 4.4
RBM12-204ENST00000424458 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.49■■■■■ 4.39
RBM12-204ENST00000424458 ARAP1Q96P48 1450 aa42.49■■■■■ 4.39
RBM12-204ENST00000424458 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.45■■■■■ 4.39
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