RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561688.1

ECI1-202, Transcript of enoyl-CoA delta isomerase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECI1, Length 705 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1-202ENST00000561688 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.21■■■■■ 8.03
ECI1-202ENST00000561688 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.06■■■■■ 6.89
ECI1-202ENST00000561688 ABCC9O60706 1549 aa57.17■■■■■ 6.74
ECI1-202ENST00000561688 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.88■■■■■ 6.38
ECI1-202ENST00000561688 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.86■■■■■ 6.37
ECI1-202ENST00000561688 NACADO15069 1562 aa54.73■■■■■ 6.35
ECI1-202ENST00000561688 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.27■■■■■ 6.28
ECI1-202ENST00000561688 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.23■■■■■ 6.27
ECI1-202ENST00000561688 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.93■■■■■ 6.22
ECI1-202ENST00000561688 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.43■■■■■ 6.14
ECI1-202ENST00000561688 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.43■■■■■ 6.14
ECI1-202ENST00000561688 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.07■■■■■ 6.09
ECI1-202ENST00000561688 SCRIBQ14160 1630 aa53■■■■■ 6.08
ECI1-202ENST00000561688 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.65■■■■■ 6.02
ECI1-202ENST00000561688 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.62■■■■■ 6.01
ECI1-202ENST00000561688 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.79■■■■■ 5.88
ECI1-202ENST00000561688 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.64■■■■■ 5.86
ECI1-202ENST00000561688 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.41■■■■■ 5.82
ECI1-202ENST00000561688 SMARCA4P51532 1647 aa50.64■■■■■ 5.7
ECI1-202ENST00000561688 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.6■■■■■ 5.69
ECI1-202ENST00000561688 NCAPD3P42695 1498 aa50.49■■■■■ 5.67
ECI1-202ENST00000561688 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.47■■■■■ 5.67
ECI1-202ENST00000561688 SMARCA2P51531 1590 aa50.44■■■■■ 5.67
ECI1-202ENST00000561688 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.22■■■■■ 5.63
ECI1-202ENST00000561688 HMGXB3Q12766 1538 aa50.19■■■■■ 5.62
ECI1-202ENST00000561688 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.12■■■■■ 5.61
ECI1-202ENST00000561688 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.1■■■■■ 5.61
ECI1-202ENST00000561688 WIZO95785 1651 aa49.66■■■■■ 5.54
ECI1-202ENST00000561688 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.59■■■■■ 5.53
ECI1-202ENST00000561688 ERCC6Q03468 1493 aa49.39■■■■■ 5.5
ECI1-202ENST00000561688 NESP48681 1621 aa49.32■■■■■ 5.49
ECI1-202ENST00000561688 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.21■■■■■ 5.47
ECI1-202ENST00000561688 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.16■■■■■ 5.46
ECI1-202ENST00000561688 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.05■■■■■ 5.44
ECI1-202ENST00000561688 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.99■■■■■ 5.43
ECI1-202ENST00000561688 CUX2O14529 1486 aa48.89■■■■■ 5.42
ECI1-202ENST00000561688 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.69■■■■■ 5.39
ECI1-202ENST00000561688 CFTRP13569 1480 aa48.65■■■■■ 5.38
ECI1-202ENST00000561688 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.6■■■■■ 5.37
ECI1-202ENST00000561688 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.59■■■■■ 5.37
ECI1-202ENST00000561688 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.48■■■■■ 5.35
ECI1-202ENST00000561688 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.47■■■■■ 5.35
ECI1-202ENST00000561688 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.43■■■■■ 5.34
ECI1-202ENST00000561688 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.3■■■■■ 5.32
ECI1-202ENST00000561688 WDR62O43379 1518 aa48.22■■■■■ 5.31
ECI1-202ENST00000561688 PRDM2Q13029 1718 aa48.17■■■■■ 5.3
ECI1-202ENST00000561688 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.94■■■■■ 5.26
ECI1-202ENST00000561688 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.74■■■■■ 5.23
ECI1-202ENST00000561688 ABCC8Q09428 1581 aa47.71■■■■■ 5.23
ECI1-202ENST00000561688 TOPBP1Q92547 1522 aa47.64■■■■■ 5.22
ECI1-202ENST00000561688 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.56■■■■■ 5.2
ECI1-202ENST00000561688 IFT140Q96RY7 1462 aa47.46■■■■■ 5.19
ECI1-202ENST00000561688 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.21■■■■■ 5.15
ECI1-202ENST00000561688 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.19■■■■■ 5.14
ECI1-202ENST00000561688 CUX1P39880 1505 aa47.15■■■■■ 5.14
ECI1-202ENST00000561688 SOGA1O94964 1423 aa47.1■■■■■ 5.13
ECI1-202ENST00000561688 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.08■■■■■ 5.13
ECI1-202ENST00000561688 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
ECI1-202ENST00000561688 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.02■■■■■ 5.12
ECI1-202ENST00000561688 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
ECI1-202ENST00000561688 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.95■■■■■ 5.119e-7■■■□□ 18.2
ECI1-202ENST00000561688 OSCARQ8IYS5 282 aa46.93■■■■■ 5.1
ECI1-202ENST00000561688 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.85■■■■■ 5.09
ECI1-202ENST00000561688 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.83■■■■■ 5.09
ECI1-202ENST00000561688 WDR97A6NE52 1622 aa46.76■■■■■ 5.08
ECI1-202ENST00000561688 TOP2BQ02880 1626 aa46.68■■■■■ 5.06
ECI1-202ENST00000561688 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.64■■■■■ 5.06
ECI1-202ENST00000561688 SYNJ1O43426 1573 aa46.61■■■■■ 5.05
ECI1-202ENST00000561688 FBLN2P98095 1184 aa46.61■■■■■ 5.05
ECI1-202ENST00000561688 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.59■■■■■ 5.05
ECI1-202ENST00000561688 GRIN2BQ13224 1484 aa46.56■■■■■ 5.04
ECI1-202ENST00000561688 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.52■■■■■ 5.04
ECI1-202ENST00000561688 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.5■■■■■ 5.03
ECI1-202ENST00000561688 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.45■■■■■ 5.03
ECI1-202ENST00000561688 CHD1O14646 1710 aa46.42■■■■■ 5.02
ECI1-202ENST00000561688 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.41■■■■■ 5.02
ECI1-202ENST00000561688 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.37■■■■■ 5.01
ECI1-202ENST00000561688 PBRM1Q86U86 1689 aa46.33■■■■■ 5.01
ECI1-202ENST00000561688 SYNJ2O15056 1496 aa46.27■■■■■ 5
ECI1-202ENST00000561688 TRIM41Q8WV44 630 aa46.17■■■■■ 4.98
ECI1-202ENST00000561688 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.05■■■■■ 4.96
ECI1-202ENST00000561688 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.03■■■■■ 4.96
ECI1-202ENST00000561688 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.03■■■■■ 4.96
ECI1-202ENST00000561688 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.03■■■■■ 4.96
ECI1-202ENST00000561688 ARHGEF11O15085 1522 aa46.03■■■■■ 4.96
ECI1-202ENST00000561688 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.98■■■■■ 4.95
ECI1-202ENST00000561688 ADAMTS12P58397 1594 aa45.97■■■■■ 4.95
ECI1-202ENST00000561688 KIF27Q86VH2 1401 aa45.93■■■■■ 4.94
ECI1-202ENST00000561688 GRIN2AQ12879 1464 aa45.93■■■■■ 4.94
ECI1-202ENST00000561688 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.92■■■■■ 4.94
ECI1-202ENST00000561688 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.75■■■■■ 4.91
ECI1-202ENST00000561688 NUP160Q12769 1436 aa45.7■■■■■ 4.91
ECI1-202ENST00000561688 IGF1RP08069 1367 aa45.7■■■■■ 4.91
ECI1-202ENST00000561688 CEP170Q5SW79 1584 aa45.64■■■■■ 4.9
ECI1-202ENST00000561688 ARAP1Q96P48 1450 aa45.61■■■■■ 4.89
ECI1-202ENST00000561688 CUL7Q14999 1698 aa45.57■■■■■ 4.89
ECI1-202ENST00000561688 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.47■■■■■ 4.87
ECI1-202ENST00000561688 JPH4Q96JJ6 628 aa45.35■■■■■ 4.85
ECI1-202ENST00000561688 SHROOM2Q13796 1616 aa45.33■■■■■ 4.85
ECI1-202ENST00000561688 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.29■■■■■ 4.84
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