Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC42.84■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC42.78■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC42.77■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC42.68■■■■■ 4.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC42.56■■■■■ 4.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms