Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB12Q9Y5F1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB12Q9Y5F1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms