Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3BQ9UH17 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3BQ9UH17 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBEC3BQ9UH17 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3BQ9UH17 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms