Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHA6Q9UF33 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA6Q9UF33 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHA6Q9UF33 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHA6Q9UF33 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms